164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1710 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  28.12 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  28.12 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  25.77 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 272 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  25.39 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 318 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 316 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 273 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 317 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 318 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 318 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 316 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 316 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 318 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 276 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 273 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  25.64 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 272 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 273 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 273 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 295 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 290 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  29.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  28.74 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  39.74 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  26.83 
 
 		 340 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  31.49 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  38.89 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  35.82 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3610  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  36.14 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  40.91 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  23.18 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>