More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5271 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  27.69 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  27.91 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  27.07 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  30.57 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  39.29 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 770 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1151  transcriptional regulator TetR family  29.41 
 
 		 182 aa  51.6  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 269 aa  51.6  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  24.12 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4880  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  23.56 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  23.53 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  28.03 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  28.09 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 237 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>