145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4880 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4880  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0175  hypothetical protein  50.47 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 280 aa  48.5  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  32.61 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  34.44 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  38.24 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  38.24 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 677 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 260 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 198 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 178 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25.54 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  35.85 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  35.85 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  30.67 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  30.67 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  30.67 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  30.67 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2875  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  35.85 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  30.67 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  30.67 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  30.67 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  32.81 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  25.23 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  34.55 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>