132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A4968 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  100 
 
 
197 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  95.43 
 
 
197 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
222 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 
213 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  32.99 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
240 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  30.91 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 
677 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  27.5 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0255482 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0868398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  26.89 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  30.59 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 
194 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 
194 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  37.88 
 
 
198 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 
194 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  32.35 
 
 
195 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
220 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  25 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
195 aa  51.6  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  25 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  31.03 
 
 
196 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 
298 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.04 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  35.71 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  31.76 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  22.05 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 
221 aa  48.9  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  32.26 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  28.79 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  30.59 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  30.59 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4880  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 
224 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 
211 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
202 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 
218 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
221 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  33.93 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  35.71 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  35.71 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  29.03 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  24.55 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>