192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1316 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 298 aa  598  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 201 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 200 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 202 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 207 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 207 aa  125  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 221 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 203 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 214 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 199 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 194 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 201 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 209 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  27.72 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 190 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.72 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.72 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.72 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.72 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.72 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 251 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 198 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 141 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 198 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 198 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  26.46 
 
 		 230 aa  49.3  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 202 aa  49.3  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  26.51 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 193 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 193 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 197 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  27.51 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 200 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 193 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 189 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 189 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 236 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 219 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 213 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 		 193 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 207 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 198 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 222 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 175 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 193 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 214 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 199 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 210 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 195 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 200 aa  45.8  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  31.71 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  31.43 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>