295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3831 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 191 aa  94.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  44.74 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  44.83 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  27.53 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 141 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  38.67 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  35.09 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  44.93 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 298 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  33.78 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  25.58 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 239 aa  48.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 280 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  35 
 
 		 346 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  40.51 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  44.74 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  37.5 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  37.74 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  38.81 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  40.38 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>