103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6683 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  39.02 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 192 aa  91.7  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3737  hypothetical protein  39.23 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2703  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00115407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  27.08 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  33.73 
 
 		 635 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  34.09 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  41.1 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  35 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4946  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  22.14 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  46 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 203 aa  44.7  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  38.33 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  28.36 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 200 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 205 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 230 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  32.81 
 
 		 198 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 263 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 242 aa  42  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 245 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4575  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>