65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1470 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  35.16 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  32.4 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 635 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 346 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  27.65 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2703  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00115407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 181 aa  44.7  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 191 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 225 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 183 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 178 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 228 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  20.83 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  20.83 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 213 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>