214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2410 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  72.77 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  58.65 
 
 		 635 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1563  transcriptional regulator, TetR family  52.97 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5188  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  29.76 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  42.86 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  26.67 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  41.27 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  30.51 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  43.86 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  40.82 
 
 		 186 aa  45.1  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1527  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.718491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  46.15 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>