190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6235 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  76.29 
 
 		 214 aa  282  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  58.45 
 
 		 635 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1563  transcriptional regulator, TetR family  49.75 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5188  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.19 
 
 		 178 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 178 aa  52  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  26.19 
 
 		 178 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 195 aa  52  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  32.35 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  47.62 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 429 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  22 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 126 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  33.64 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  48.08 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  41.38 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  38.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 414 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 249 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  40.98 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 298 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 200 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 221 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  48.98 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>