More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3510 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  30.9 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  30.82 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  29.38 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  31.52 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  30.6 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 230 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  32.48 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 226 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 234 aa  47.8  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 343 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  33.78 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 418 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 635 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>