More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3380 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 222 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 212 aa  241  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  57.22 
 
 		 226 aa  225  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 335 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  27.38 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1599  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  22.79 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 289 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 268 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  22.61 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  38.67 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0304  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 141 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  32.56 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 311 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  31.46 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 126 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.7 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 186 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.19 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.19 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.19 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.19 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.19 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5158  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>