More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1574 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  95.5 
 
 		 200 aa  381  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  56.7 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 349 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.22 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  30.41 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  29.89 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  30.63 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  30.38 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  27.54 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  29.31 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  36.25 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  35.62 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>