91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6166 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
197 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  32.37 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  33.54 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 
192 aa  55.1  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 
209 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  31.37 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1805  hypothetical protein  25.41 
 
 
202 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
219 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
225 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 
195 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
200 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  22.67 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
245 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
225 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  35 
 
 
208 aa  44.7  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 
198 aa  44.7  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 
349 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  32.91 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6134  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0948812  normal  0.0489287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  29.82 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  29.87 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  26.49 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
251 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  39.22 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
205 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 
225 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
424 aa  42.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  26.62 
 
 
227 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  27.83 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  39.22 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
210 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 
209 aa  42  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  32.95 
 
 
197 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 
197 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
230 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
242 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
185 aa  41.6  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
196 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 
203 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  39.22 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  39.22 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  39.22 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  39.22 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  39.22 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  39.22 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  39.22 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
227 aa  41.6  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 
244 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  29.55 
 
 
215 aa  41.2  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
223 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
255 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  39.22 
 
 
194 aa  41.2  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>