More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3172 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  440  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  98.61 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  93.52 
 
 		 216 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  28.72 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  27.69 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  27.69 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  27.69 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  27.91 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  27.91 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  27.91 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  27.91 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  28.72 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  28.72 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  28.99 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  28.21 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  29.7 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  29.94 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  29.94 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  29.94 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  29.94 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  29.94 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  29.94 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  29.94 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  32.54 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  28.48 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  32.12 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  27.65 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  29.01 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  31.52 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  29.01 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  29.01 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  29.01 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  29.01 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  29.01 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  29.01 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  26.79 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  30.77 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  28.95 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  29.26 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  29.48 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  27.17 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  29.46 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  23.56 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  23.98 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  27.71 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  29.07 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  26.79 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  24.71 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  26.95 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  24.4 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 677 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  26.38 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  24.12 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  28.4 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  24.57 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.67 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  29.82 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  27.65 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  27.65 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  30.41 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  26.32 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 126 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  26.35 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  27.49 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  28.37 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  25.98 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  25.98 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  26.47 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  25.71 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>