More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4542 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 241 aa  141  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  21.14 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 414 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 423 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  27.34 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  19.25 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  20.24 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 248 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  18.63 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  22.14 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  27.5 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>