More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1684 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  96.5 
 
 		 202 aa  387  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  77.23 
 
 		 202 aa  314  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  68.81 
 
 		 202 aa  284  8e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  68.81 
 
 		 202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  68.81 
 
 		 202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  68.81 
 
 		 202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  68.81 
 
 		 202 aa  282  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  69.7 
 
 		 202 aa  260  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 202 aa  254  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  70.71 
 
 		 202 aa  242  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  64.25 
 
 		 200 aa  234  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  55.5 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  73.19 
 
 		 139 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  45.5 
 
 		 199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 212 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  51.05 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 181 aa  85.5  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  31.37 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.06 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  24.05 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  27 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  23.42 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  21.82 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  27.45 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  27.88 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  21.21 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  29.81 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  26.04 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  29.81 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  29.81 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  26.54 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  25.17 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  21.21 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  21.21 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  23.42 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  25.34 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  24.75 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  20.61 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  20.61 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  20.61 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  20.61 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  27.45 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  26.97 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0336  nucleoid occlusion protein  24.49 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  23.56 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 257 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  26.16 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  25.49 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1012  hypothetical protein  27.54 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  25.16 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  20 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  26.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  30.41 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  32.18 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4584  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  23.27 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  18.63 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  22.86 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>