283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4584 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4584  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  93.43 
 
 		 198 aa  370  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  92.42 
 
 		 198 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  39.51 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  29.5 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  24.87 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 770 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 247 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4473  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.85 
 
 		 251 aa  48.9  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 255 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 256 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 248 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  43.33 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  31.4 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  34.57 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 451 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 451 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 428 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.23 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.67 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 408 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>