More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3709 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 196 aa  291  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  67.18 
 
 		 195 aa  279  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  67.18 
 
 		 196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 196 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 213 aa  104  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 181 aa  98.2  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  32 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  32.67 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  29.17 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  23.4 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  23.4 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  29.37 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  25.29 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  31.31 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0052  nucleoid occlusion protein  30.92 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.881528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  30.92 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0058  nucleoid occlusion protein  30.92 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00579463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  27.36 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4103  nucleoid occlusion protein  30.92 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0313607  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  26.55 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3963  nucleoid occlusion protein  32.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000172432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  29.25 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0155  nucleoid occlusion protein  29.61 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4393  nucleoid occlusion protein  30.26 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000163426  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  27.91 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  28.3 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  28.3 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  28.3 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  28.3 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  28.95 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  28.3 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  28.3 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>