293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0111 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  23.5 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  23.5 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  19.01 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  21.83 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  22.02 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  20.38 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  22.87 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  20.33 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>