More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1061 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
196 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  41.08 
 
 
219 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
203 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
205 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.5 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  27.5 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  30.72 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  33.79 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  34.02 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
254 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
190 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
254 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
254 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
254 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
254 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
254 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
254 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4584  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  32.69 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>