More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2778 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  416  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  52.48 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  23.44 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  24.15 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  39.24 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.95 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  44.44 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  44.44 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  44.44 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  44.44 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  44.44 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  22.06 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  44.44 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  44.44 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.32 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.32 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>