More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0765 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 291 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 184 aa  62  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 770 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
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NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
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NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
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NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
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NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
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