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for query gene Plav_1768 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 210 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  98.6  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 225 aa  98.2  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 227 aa  91.7  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 188 aa  89  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
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NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
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NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.59 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  27.64 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.5 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  29.69 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
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NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
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