More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0959 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  96.36 
 
 		 259 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  82.93 
 
 		 254 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  72.38 
 
 		 248 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  69.58 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  69.58 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  69.67 
 
 		 258 aa  348  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  69.58 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  69.58 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  69.58 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  69.58 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  69.58 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  71.97 
 
 		 248 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  71.97 
 
 		 248 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 248 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  69.17 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  70.87 
 
 		 248 aa  335  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  68.33 
 
 		 248 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  62.39 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  61.14 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  56.89 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  58.58 
 
 		 248 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  23.04 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  23.04 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.6 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 198 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 198 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  22.36 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  21.6 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4584  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  21.28 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>