More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0347 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 188 aa  111  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  36.93 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  35.83 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 234 aa  91.3  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  37.95 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  32.62 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.37 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  30.34 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
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NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
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NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
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NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
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NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0615  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
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NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
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NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
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NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
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