More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6181 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  56.02 
 
 		 205 aa  198  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  53.76 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  48.45 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  52.88 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 219 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 219 aa  84.7  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  29.26 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 770 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.59 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.36 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.95 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  32.14 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 251 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  28.69 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>