More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0817 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  45.31 
 
 		 196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  47.74 
 
 		 202 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  46.07 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  45.55 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
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NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  34.88 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 285 aa  92.8  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
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NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 220 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
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NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
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NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
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NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
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NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  25.48 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  31.05 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.36 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
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NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 497 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.21 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  24.31 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  22.5 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
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NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 770 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
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NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
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NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
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NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
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