More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2996 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 196 aa  250  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  63.59 
 
 		 209 aa  241  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  61.14 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 194 aa  220  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  43.16 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 220 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 202 aa  87.8  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 285 aa  84.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  34.1 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  33.89 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  27.91 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 251 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  26.29 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.81 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  21.55 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  20.21 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  21.64 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>