More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0412 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 203 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 398 aa  102  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 376 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  29.59 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  21.16 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  21.16 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.03 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  45.59 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  20.9 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>