More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3910 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  56.56 
 
 		 242 aa  254  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 228 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 228 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  36.63 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 200 aa  105  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 203 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  31.61 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 497 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.12 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  20.77 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  36.08 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  32.41 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  32.41 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  32.41 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  31.48 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  31.19 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>