More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0503 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
376 aa  747    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
398 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
202 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
212 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
209 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
212 aa  90.1  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 
201 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
195 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  29.17 
 
 
197 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
211 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 
203 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
218 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  26.25 
 
 
240 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
197 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 
184 aa  57.4  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
206 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 
196 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
225 aa  56.2  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 
215 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  39.68 
 
 
211 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
207 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 
194 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 
201 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
209 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
212 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
197 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
213 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 
291 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 
289 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
201 aa  53.1  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
217 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
217 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
220 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 
193 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
217 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
220 aa  52.8  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
217 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
210 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
197 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 
242 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 
201 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
201 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
197 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 
211 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
217 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
217 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 
190 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  23.18 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
209 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
217 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
214 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 
470 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 
188 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  30.1 
 
 
203 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
217 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
211 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
205 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
290 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
197 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
192 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
203 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
205 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
205 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 
221 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  38.6 
 
 
278 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 
219 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
239 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 
195 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 
205 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
217 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
206 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
206 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
206 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 
198 aa  50.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
194 aa  50.4  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
217 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
211 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
200 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
204 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  22.18 
 
 
393 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
206 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 
189 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
202 aa  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  31.43 
 
 
205 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  25 
 
 
225 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 
195 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
212 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>