More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_1963 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
201 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  97.95 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  97.95 
 
 
195 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  97.95 
 
 
195 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
211 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
212 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
202 aa  131  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  30.3 
 
 
240 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  26.09 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
376 aa  72.4  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
204 aa  62  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
201 aa  61.2  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  46.77 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
220 aa  58.9  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
210 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 
242 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
242 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  24.35 
 
 
225 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 
243 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
324 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  28.71 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
209 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
191 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
192 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
192 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
211 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
269 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 
246 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
228 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>