More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2904 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  430  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  42.44 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  41.15 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 242 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 242 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  30.5 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  20.19 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  21.9 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  20.75 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  20.48 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  29.51 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  27.6 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  40.54 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  27.81 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  32.53 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  28.96 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  21.34 
 
 		 288 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  31.82 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  33.9 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  27.5 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.48 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>