More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3447 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  100 
 
 		 199 aa  413  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  59.69 
 
 		 213 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 212 aa  118  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  29.33 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  35.56 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  27.59 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 239 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 288 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>