275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2032 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  81.95 
 
 		 212 aa  348  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  39.6 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  25.29 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 332 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  24.87 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 497 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  24.47 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  24.31 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 357 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  23.26 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.71 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>