More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4245 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 221 aa  427  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 438 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39.06 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  43.86 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  35.48 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  36.47 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 446 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  44.64 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>