More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0755 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  46.71 
 
 		 207 aa  144  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 195 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  42.08 
 
 		 190 aa  131  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  42.44 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 184 aa  72  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  35.75 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  42.68 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  43.56 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  44.29 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  51.79 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  31.22 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  30.43 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  50.88 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0215  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  32 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  30.51 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 198 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>