More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  44.67 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 208 aa  141  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  25.63 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 229 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 243 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 385 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  22 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 260 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  29.35 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 240 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5848  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.143207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 324 aa  45.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 183 aa  44.7  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  27.38 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>