160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7432 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  420  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  51.04 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  35.76 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  55.93 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  46.34 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  32.09 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  46.03 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  41.89 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  31.62 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  48.21 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  40.21 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  40.79 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 174 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>