96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0665 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  357  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  76.4 
 
 		 180 aa  278  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  68.16 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  68.16 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  68.16 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  39.13 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  35.8 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  33.15 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  34.09 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  34.1 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  34.09 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  32.95 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  32.92 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  35.67 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  33.15 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  32.14 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  33.96 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  30.06 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  28.02 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  29.44 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  21.84 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 231 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  28.68 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 211 aa  44.7  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 226 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 205 aa  44.3  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  26.9 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 192 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 241 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  35.94 
 
 		 204 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1919  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543101  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 230 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 227 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 209 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 209 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 197 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>