More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4466 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  86.07 
 
 		 206 aa  345  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  62.89 
 
 		 202 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  64.53 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  64.53 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  64.53 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  46.74 
 
 		 194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  41.85 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11804  transcriptional regulator  27.57 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000865181  hitchhiker  0.00796051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  26.78 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1188  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  26.98 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 236 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 226 aa  51.2  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 183 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  35.14 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  36 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  27.01 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1240  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  28.14 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 255 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  40.98 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 271 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3965  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396199  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  25.85 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  41.07 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  34.67 
 
 		 390 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>