103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3350 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  45.56 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  40.53 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 232 aa  91.7  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  47.83 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  30.25 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  33.33 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  29.55 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  28.25 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  24.34 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  29.11 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  31.17 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  26 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 217 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 217 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 217 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 217 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 242 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 250 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 173 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 173 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 173 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4117  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 217 aa  41.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 176 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 174 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>