107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4117 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4117  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  38.74 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1245  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 179 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.79 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  29.29 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  41.51 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  41.51 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  25.13 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1198  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  28.95 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  29.41 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  29.87 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 209 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 203 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  35.82 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 223 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  58.06 
 
 		 179 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 185 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 206 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 198 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 212 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 226 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  54.84 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05630  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 90 aa  41.6  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>