31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3155 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  100 
 
 		 201 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  47.8 
 
 		 184 aa  187  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 219 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4250  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141169  normal  0.0239439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  20.88 
 
 		 180 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  38.6 
 
 		 215 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 185 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  47.62 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 406 aa  41.2  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>