28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3660 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 203 aa  408  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6398  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237377  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  36.54 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 217 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  36.17 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  44 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>