35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3104 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  39.01 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  20.35 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 201 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 230 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  20.53 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  23.53 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 256 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  19.88 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  19.88 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  19.88 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>