68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8493 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 180 aa  359  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 210 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  28.57 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  26.14 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  29.7 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  26.58 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  24.02 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  26.18 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  28.41 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  26.97 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  25.32 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  20.67 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  23.58 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  30.6 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05660  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  31.84 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0537  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  20.88 
 
 		 201 aa  42  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 204 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 209 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  26.55 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 199 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>