178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5576 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  421  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  45.03 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  41.08 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  40.11 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  39.31 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  29.74 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  36.47 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 183 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  31.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  21.56 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>