104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2994 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  51.49 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2890  hypothetical protein  68.75 
 
 		 88 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  36.81 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  26.62 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 179 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  34.29 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 189 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  39.51 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  30.25 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  39.36 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  49.21 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  29.58 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  40.23 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  27.7 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  40.54 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 193 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 222 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 195 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 181 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  42  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 250 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 190 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 215 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>